MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009929	TAG	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009929	CAA	2	6	44	49	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009929	TGG	2	6	76	81	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009929	CTC	2	6	87	92	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009929	ATC	2	6	295	300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009929	TTA	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009929	GTTT	2	8	468	475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009929	GAT	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009929	GAA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009929	GA	3	6	907	912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009929	T	6	6	914	919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009929	CCT	2	6	1182	1187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009929	GTA	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009929	TGG	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009929	AGA	2	6	3294	3299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009929	CAG	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009929	AC	3	6	3601	3606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009929	AGA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009929	GCA	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009929	AAAT	2	8	3895	3902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009929	ACG	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009929	GTCC	2	8	5241	5248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009929	GAA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009929	CTCAAA	2	12	6107	6118	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009929	CT	3	6	6122	6127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009929	TAA	2	6	6149	6154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009929	CAAA	2	8	6221	6228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009929	ATA	2	6	6360	6365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009929	TCAAA	2	10	6908	6917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009929	TAT	2	6	6976	6981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009929	TAA	2	6	7822	7827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009929	GA	3	6	7875	7880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009929	ACTCA	2	10	7916	7925	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009929	ATG	2	6	8864	8869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009929	TTC	2	6	8898	8903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009929	T	6	6	10589	10594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009929	T	6	6	10847	10852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009929	TTA	2	6	10855	10860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009929	T	6	6	10895	10900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009929	TAT	2	6	10908	10913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009929	CAG	2	6	10962	10967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009929	TAT	2	6	10973	10978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009929	AAT	2	6	10988	10993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009929	TAT	2	6	11001	11006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009929	T	6	6	13596	13601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009929	GTT	2	6	15150	15155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009929	AAG	2	6	15156	15161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009929	ACTA	2	8	15233	15240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009929	AGC	2	6	15261	15266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009929	TAAA	2	8	15650	15657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009929	CAA	2	6	15796	15801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009929	TTG	2	6	15995	16000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009929	TTG	3	9	16031	16039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009929	TGT	2	6	17197	17202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009929	TCT	2	6	17240	17245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009929	TTA	2	6	17336	17341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009929	TGC	2	6	17346	17351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009929	CTA	2	6	17403	17408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009929	TG	3	6	17418	17423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009929	TTAA	2	8	17429	17436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009929	GATC	2	8	17452	17459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009929	AGG	2	6	17500	17505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009929	CAA	2	6	17663	17668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009929	T	7	7	17750	17756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009929	CAG	2	6	21343	21348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009929	ATT	3	9	21365	21373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009929	AGC	2	6	21464	21469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009929	CTA	2	6	21688	21693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009929	GAT	2	6	21879	21884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009929	T	6	6	23944	23949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009929	T	6	6	24062	24067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009929	TGT	2	6	24082	24087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009929	T	6	6	26000	26005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009929	AACTC	2	10	26192	26201	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009929	CCA	2	6	26369	26374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009929	AC	3	6	26632	26637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009929	T	6	6	34904	34909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009929	GAA	2	6	34916	34921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009929	ATT	2	6	34990	34995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009929	A	6	6	35102	35107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009929	TG	3	6	35268	35273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009929	TGG	2	6	35299	35304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009929	AGA	2	6	35337	35342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009929	ATCT	2	8	35868	35875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009929	T	7	7	35894	35900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009929	TGT	2	6	35921	35926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009929	ATTG	2	8	35989	35996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009929	T	6	6	36033	36038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009929	GAGG	2	8	36046	36053	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009929	TA	3	6	36054	36059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009929	TCC	2	6	36861	36866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009929	TTG	2	6	36911	36916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009929	TTG	2	6	39110	39115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009929	ATT	2	6	39271	39276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009929	CTG	2	6	39358	39363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009929	AAG	2	6	39384	39389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009929	A	7	7	39423	39429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009929	ATT	2	6	39454	39459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009929	A	7	7	39559	39565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009929	AGAAT	2	10	40554	40563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009929	GC	3	6	40574	40579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009929	ACT	2	6	40621	40626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009929	AGT	2	6	40670	40675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009929	GTG	2	6	40705	40710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009929	CTA	2	6	40799	40804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009929	CTT	2	6	40942	40947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009929	A	6	6	41243	41248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009929	AAT	2	6	41300	41305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009929	T	8	8	41317	41324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009929	CT	3	6	44378	44383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009929	AAATCT	2	12	46234	46245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009929	ATAA	2	8	46701	46708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009929	TCT	2	6	47011	47016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009929	AG	4	8	47058	47065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009929	T	6	6	47082	47087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009929	CAG	2	6	47219	47224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009929	GCC	2	6	47294	47299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009929	TGGA	2	8	47330	47337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009929	ACT	2	6	47392	47397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009929	ATG	2	6	47435	47440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009929	AAG	2	6	47501	47506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009929	CAT	2	6	47524	47529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009929	GCTCA	2	10	47557	47566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_009929	TGG	2	6	47721	47726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009929	GGC	2	6	47779	47784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009929	TG	3	6	47819	47824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009929	CAA	2	6	47850	47855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009929	TC	3	6	47864	47869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009929	ACG	2	6	47910	47915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009929	TCG	2	6	47934	47939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009929	CTTTGA	2	12	47946	47957	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_009929	CAG	2	6	47974	47979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009929	A	7	7	48020	48026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009929	CAC	2	6	48220	48225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009929	GTCCAT	2	12	48248	48259	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009929	GAA	2	6	48268	48273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009929	GCA	2	6	48285	48290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009929	TCAAGA	2	12	48472	48483	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_009929	CTAC	2	8	48499	48506	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009929	CTC	2	6	48632	48637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009929	CAG	2	6	48640	48645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009929	CTTA	2	8	49468	49475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009929	GAT	2	6	49592	49597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009929	TTC	2	6	55473	55478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009929	GTT	2	6	55502	55507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009929	A	6	6	55521	55526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009929	TAT	2	6	55745	55750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_009929	TAA	2	6	174424	174429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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